Program
1. Kitab yang dikaji
a. I`dadiyyah
· Al Qur`an
· Tata Cara Sholat dan Wudlu
· Wiridan
· Doa Pendek
b. Marhalah Ula
· Kitab Jurumiyyah
· Kitab Yakulu
· Kitab Imrithi
· Kitab Shorof Kaelani
· Kitab Sulam At Taufiq
· Kitab Safinatunnaja
· Kitab Ta`lim Muta`alim
· Kitab Tuhfatul `Atfal
c. Marhalah Tsani
· Kitab Tarsif
· Kitab Shorof Kaelani
· Kitab Imrithi
· Kitab Alfiyyah
· Kitab Bajuri
· Kitab Sulam At Taufiq
· Kitab Yakulu
· Kitab Safinatunnaja
· Kitab Jurumiyyah
d. Marhalah `Aliyy
· Kitab Tafsir Jalalen
· Kitab Alfiyyah
· Mantiq
· Hikam
2. Program Pengajian
a. Mingguan
· Selasa Malam I & III : Pengetahuan Umum
· Rabu Sore : Kitab Bidayah
· Kamis Sore : Kitab Ta`lim Muta`alim
· Malam Kamis : Pendidikan Tilawatil Qur`an
· Malam Jum`at : Riyadhoh dan Kegiatan Asrama
· Jum`at Pagi : Olahraga
· Ahad Pagi : Kuliah Shubuh atau Bahtsul Masa`il
· Ahad, Kamis dan Jum`at : Kursus Komputer
b. Bulanan
· Malam Rabu Pertama : Peksian Tasrifan
· Malam Rabu Ke-Dua : Peksian Kitab
· Malam Rabu Ke-Tiga : Tarbiyyatul Muballigh
· Malam Rabu Ke-Empat : Tarbiyyatul Muballighoh
c. Tahunan
· Pengajian Alfiyyah Tahunan Warga Santri Al Munawwar (Patwa Salwa).
3. Program Umum
· Reuni Alumni (Ikasalwa – Ikatan Alumni Santri Al Munawwar)
· Majelis Ta`lim Al Munawwar
· Pegajian Muda Mudi (Ikmal – Ikatan Muda Mudi Al Munawwar)
· Pengajian Anak-Anak (Iksan Prima – Ikatan Santri Pribumi Al Munawwar)
· Zaula Salwa (Ziarah Auliya Santri Al Munawwar)